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上海交通大学医学院附属仁济医院消化科,以上海市消化疾病研究所(国内第一个)的临床和基础部分为主体组成。系国家重点学科牵头单位(1989年起至今)、国家211工程重点学科、上海市重点学科(消化内科,优势学科)、卫生部消化内科重点实验室(国内唯一)、上海市消化内科临床医学中心、上海市消化内科临床质量控制中心。
消化科现有病床112张、内镜中心占地1300平方米、实验室面积1000平方米。学科中,江绍基院士是我国消化病学界第一位中国工程院院士,萧树东教授目前担任上海市消化疾病研究所名誉所长和亚太消化病学会主席、曾任中华医学会消化病分会主任委员。
学科中拥有正高级职称员工15人、副高者近20名;博士生导师8人(现职4人)、硕士生导师14人。现有医生52名。近2年消化科门诊量20-30万人次/年、内镜量超过5万人次/年。